December 2nd, 2013

Первый явно обнаруженный магниторецептор у животных

На Society for Neuroscience пару недель назад, впервые я увидел сообщение, постер, где были собраны достаточно убедительные доказательства существования магниторецепторов у C. elegans. Представлял всё это Andres Vidal-Gadea из Pierce-Shimomura Lab (U Texas at Austin). Рукопись ждет своего часа в Nature, а пока они добирают данные. У C. elegans как известно клеток мало, и это два нейрона AFD (AFDL&AFDR), информацию по которым можно найти в этой онлайн базе данных. Изначально нашли, что это термо и CO2 рецепоторы, потом выяснилось, что некоторые линии C. elegans ползут в искусственном магнитном поле, поддерживая определенный угол к линиям поля. Дальше больше. Они посмотрели, какие мутанты этого не делают (а мутантов там огромное количество, это вам не птицы). Выяснилось, что НЕ демонстрируют этого те линии, у которых мутации в AFD нейронах. Сделали Ca-imaging для этих нейронов - они lighting up когда их стимулируешь магнитным полем. Дальше, чтобы доказать, что они нейроны не down the stream, не передающие магнитный сигнал, а именно магнитнорецепторные клетки, сделали Ca-imaging у линий, у которых нет синаптических связей (блин, надо бросать птиц и заниматься вот такими моделями :)). И у этих AFD нейроны загорались при магнитной стимуляции. Я сразу задал вопрос Андреасу, а не находил ли он параллелей между экспрессией в данных нейронах и в магнитотактических бактериях (должны же они иметь схожие механизмы синтеза биомагнетита или что у них там) и он сказал, что уже посмотрел и overlapping только ОДИН ген. Как AFD нейроны конкретно воспринимают магнитное поле пока неизвестно, но у них есть цилии на конце, которые расположены на голове червя, и вроде бы в них есть железосодрежащие частички. Андрес сделал гомогенные коктейль из червей и потом обнаружил, что некоторые клетки и группы клеток вращаются вслед за вращающемся приложенным магнитным полем. Именно эти chunks of cells показывают экспрессию генов, схожую с AFD нейронами. Nature от них хочет дополнительных каких-то контролей и работа идет. Интересно, что линии червей из районов, близких к экватору, ползут в магнитном поле без определенной ориентации, а линия, на которой они работают и где они обнаружили магнитную ориентацию, выращена из британских червей. По-видимому, черви используют магнитное поле точно так же как магнитобактерии, т.е. для понимания того, где низ и где вверх и куда нужно копать. Короче, впервые я вижу явный субстрат, рецептор у животных. Система C. elegans, конечно, намного мощнее любых позвоночных, не говоря о немодельных птицах.

UPD1 Спрошенный мною на этой неделе Дэвид Кииз (David Keays) очень скептично отозвался про эту американскую группу, т.к., оказывается, он о них уже два года как знает и уже два года как пробует повторить их работу, но безрезультатно. Т.е. он думает, что черви ползут под неким углом к магнитному полю из-за некоторого артефакта, связанного с температурным градиентом (AFD нейроны в первую очередь известны как терморецепторы). Подождем официльной публикации в Nature.

К недавнему посту

про визит в Гуэлфа Brodie Butch, о точечной молекулярной эволюции в натриевых насосах у garner snake, что привело к точечным мутациям и меньшей чувствительности к тетродоксину. Вчерашняя статья в Nature подтверждает мою гипотезу о том, что эпигенетически может быть передача опыта от родителей к потомкам. Популярное изложение статьи здесь в Газета.Ру. Если кратко, у мышей вырабатывали conditioning на ацетофенон, а у детей и внуков наблюдали повышенную реакцию на ацетофенон по сравнению с контролем. При этом выращенные в пробирке особи обладали тем же свойством, что говорит о полной наследственной основе данного явления. Потом в сперматозойдах F0 поколения, как и в клетках F1 и F2 поколения обнаружили деметилирование Olfr151 гена, который как раз за реакцию на ацетофенон отвечает. Деметилирование гена вызывает его повышенную экспрессию. Т.е. каким-то образом, еще не понятно каким, первое поколение мышей, унюхав ацетофенон ольфакторным эпителием, деметилировало нужный ген в своих гаметах и передало своим потомкам вплоть до второго колена информацию о своем негативном опыте с данным запахом. Каков механизм связи между этих запаховым опытом и гаметами? Авторы статьи обсуждат вариант, что ацетофенон мог быть разнесен кровью по всему телу и в том числе дойти до половых органов и изменить метилирование определенных генов. Так то вот современная наука подтверждает, что в чем то Ламарк был прав и приобретенный опыт может передаваться по наследству, хотя нужно больше подтверждений и, если подтвердится, то нужно узнавать механизм. В приципе, можно было бы вкалывать ацетофенон непосредственно в кровь и смотреть за метилированием Olfr151 или даже делать in vitro treatments, если половые клетки способны жить вне тела достаточно долго. В целом, если это правд. это очень важная вещь для понимания того, может ли эволюция действовать точечно и быстрее, чем в старых моделях, которые предполагают мутации по широкому профилю генов и с примерно одинаковой вероятностью.

Украинское

по-моему, если отбросить эмоции и обиду за то, что Янукович и правительство сначала активно собирался, потом передумали, то сыр-бор яйца выеденного не стоит. Ассоциация с EU - это как обещание жениться, деленное на 40. ОК. Жесткий разгон полицией. Ну тогда почему декларация/требование "Украина - Европа!"??? 

Да уж

как-то не айс пока выглядит...

Из нового ТрВар про трехлетний бюджет 2014-16 гг. и средства на науку, фонды, РНФ и новые ФЦП "Кадры" (вкл. постдоков).

Увеличение РФФИ близко к индексации на инфляцию. Планы на 2015 г. и 2016 г. еще могут измениться в связи со стагнацией и трендом на секвестрирование (не только в РФ). РНФ будет для прикладных вещей. Судьба "1000 лаб" и постдоков под вопросом (может быть сильно урезано).

Похоже, что после длительной борьбы Минфин всё же оставил попытки посчитать причитающиеся научным
фондам в 2018 году согласно президентскому Указу № 599 от 7 мая
2012 года 25 млрд руб. «на троих» (т.е. считать, что столько должны получить
РФФИ, РГНФ и фонд Бортника вместе взятые, а не только РФФИ и РГНФ).
В 2014 году РФФИ будет выделено 9,2 млрд руб. (на 1,2 млрд больше,
чем в этом году), а РГНФ — 1,54 млрд руб. (практически столько же, сколько
в этом году). В 2015 году финансирование РФФИ и РГНФ также должно воз-
расти не очень значительно — до 10,9 и 1,8 млрд руб. соответственно. Зато
в 2016 году запланирован более существенный рост: РФФИ должен бу-
дет получить 14,3 млрд руб., а РГНФ — 2,4 млрд руб.
Помимо вполне предсказуемых изменений, связанных с недавно приня-
тым законом о РАН и президентскими указами, есть и неожиданности. Толь-
ко что созданный Российский научный фонд (РНФ) должен получить в буду-
щем году аж 11,4 млрд руб., т.е. больше, чем РФФИ и РГНФ, вместе взятые.
Хорошо, что опасения ученых относительно возможности финансирования
РНФ за счет урезания бюджета традиционных фондов не оправдались, во
всяком случае, пока. Однако и лишних денег в нынешней нелегкой эко-
номической ситуации в науку не пришло, поэтому возникает вопрос, отку-
да взяли серьезные деньги, которые достанутся РНФ?
Похоже, что в значительной степени эти средства будут взяты из бюджета
ФЦП «Кадры» 2014–2020. Во всяком случае, в 2014 году финансирование
основной линейки конкурсов этой ФЦП (гранты для ведущих лабораторий, на-
учных групп, приглашенных исследователей и постдоков) по сравнению
с внесенным в Думу проектом закона о бюджете на 2014 год урезано бо-
лее чем на 60%, а в 2015 и 2016 годы Минобрнауки на эти цели не полу-
чит практически ничего. Таким образом, судьба «кадровой» ФЦП пока не
ясна: будет ли РНФ всего лишь «оператором», проводящим конкурсы со-
гласно утвержденной постановлением правительства РФ новой редакции
ФЦП «Кадры», или РНФ сам решит, какие конкурсы проводить на выделен-
ные ему средства.