http://trv-science.ru/2014/11/04/daleko-li-do-eboly/
http://www.nytimes.com/2013/01/29/science/link-to-african-ebola-found-in-bats-suggests-virus-is-more-widespread.html
Естественным резервуаром эболоподобных вирусов считаются крыланы, которые, хоть и летучие мыши, не близкие родственники насекомоядных летучих мышей, которых вы все видели. Оказывается, в прошлом году был найден эболоподобный филовирус (Lloviu virus) на юге Испании, в пещере Cueva del Lloviu.
http://www.plospathogens.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.ppat.1002304
Вообще, я так понимаю, что о распространении филовирусов среди разных летучих мышей, вариациях этих вирусов, патогенности, скорости изменения вирусов, о connectivity разных видов летучих мышей (кто куда летает, какие контакты между разными популяциями) известно очень мало, и тут конечно работы для биологов на многие годы.
Вот еще интересная статья.
http://www.wired.com/2014/10/bats-ebola-disease-reservoir-hosts/